Adânc în Munții Ararat din Turcia, o organizație secretă cunoscută sub numele de ARCAM a găsit ceea ce se crede a fi Arca lui Noe. Cu toate acestea, U.S. Machine Corps., o organizație necinstită a Pentagonului, vrea să preia Arca ca mijloc de supremație globală. Doar un agent special ARCAM cunoscut sub numele de Spriggan le sta în cale. Sprigganul japonez Yu Ominae face echipă cu Sprigganul francez Jean-Jacques Mondo pentru a lupta împotriva membrilor U.S. Machine Corps. condus de col. MacDougall — un băiat îmbunătățit genetic, cu puteri psionice mortale. Cu toate acestea, ei trebuie să acționeze rapid și să-l oprească pe MacDougall înainte ca acesta să folosească Arca pentru propria sa lăcomie.