În primul sezon din B: The Beginning, doi bărbați și-au confruntat propriul trecut cu mare sacrificiu. Detectivul Maverick Keith Flick a luptat împotriva demonilor săi și în cele din urmă a dezvăluit secretele întunecate din spatele Regatului Cremona. Koku, s-a reunit în cele din urmă cu cea mai prețioasă amintire din copilăria lui. Au trecut câteva luni de atunci și întreaga lume pare să fi uitat de frământările provocate de acele evenimente. În timp ce Keith se întoarce la Poliția Regală pentru a-și conduce propria investigație, Koku și Yuna încearcă să se bucure de o viață obișnuită în pace. Dar consecințele experimentelor de la Jaula Blanca sunt departe de a fi dispărute, după cum Koku descoperă curând, când apare dintr-o dată colegul său de laborator, presupus mort, Kirisame.